More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0582 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  100 
 
 
354 aa  726    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  90.11 
 
 
354 aa  642    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  87.29 
 
 
354 aa  657    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.19 
 
 
355 aa  362  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.85 
 
 
367 aa  352  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  46.86 
 
 
365 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.23 
 
 
354 aa  342  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.89 
 
 
351 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.94 
 
 
354 aa  340  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.83 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.89 
 
 
351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.02 
 
 
354 aa  335  7e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.81 
 
 
341 aa  333  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.19 
 
 
357 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.45 
 
 
353 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.45 
 
 
353 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.91 
 
 
354 aa  328  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.41 
 
 
353 aa  328  8e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.94 
 
 
354 aa  326  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.54 
 
 
354 aa  324  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.58 
 
 
356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.28 
 
 
353 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.39 
 
 
355 aa  309  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  39.94 
 
 
358 aa  302  5.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  41.24 
 
 
363 aa  301  9e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.9 
 
 
355 aa  300  3e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.78 
 
 
376 aa  295  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.62 
 
 
387 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  39.83 
 
 
375 aa  293  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.89 
 
 
368 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.35 
 
 
547 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.6 
 
 
363 aa  285  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  38.76 
 
 
380 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.58 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.06 
 
 
379 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  39.33 
 
 
354 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.5 
 
 
372 aa  280  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  40.23 
 
 
354 aa  278  8e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  39.33 
 
 
354 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.45 
 
 
360 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.73 
 
 
374 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.55 
 
 
362 aa  275  9e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.97 
 
 
385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.97 
 
 
385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.67 
 
 
375 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.89 
 
 
372 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.18 
 
 
383 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.8 
 
 
354 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.18 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.74 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.12 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.64 
 
 
382 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.69 
 
 
390 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.77 
 
 
352 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.49 
 
 
352 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.81 
 
 
395 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.31 
 
 
381 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.71 
 
 
381 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.71 
 
 
381 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.65 
 
 
353 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  32.7 
 
 
367 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.71 
 
 
374 aa  238  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.7 
 
 
327 aa  228  8e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.81 
 
 
387 aa  228  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.15 
 
 
325 aa  227  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.42 
 
 
327 aa  222  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0785  magnesium and cobalt transport protein CorA  36 
 
 
332 aa  219  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0685097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.87 
 
 
356 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.71 
 
 
339 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.45 
 
 
339 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.59 
 
 
351 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.44 
 
 
322 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.65 
 
 
355 aa  195  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.64 
 
 
291 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.87 
 
 
325 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
324 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.35 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.69 
 
 
325 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.72 
 
 
322 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  29 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.37 
 
 
333 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  31.21 
 
 
321 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.79 
 
 
325 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.97 
 
 
370 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.68 
 
 
322 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.23 
 
 
325 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2181  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.23 
 
 
314 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0833206  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
325 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2270  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.56 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0371321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.14 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.49 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.34 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.56 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  32.97 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
325 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  31.82 
 
 
325 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
325 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
325 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.68 
 
 
325 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.68 
 
 
325 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>