More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28210  Mg2+/Co2+ transporter  100 
 
 
371 aa  749    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.41 
 
 
378 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  45.36 
 
 
384 aa  289  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  48 
 
 
370 aa  279  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.36 
 
 
380 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6428  magnesium/cobalt transporter CorA  44.03 
 
 
380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  47.74 
 
 
375 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.77 
 
 
331 aa  252  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  43 
 
 
322 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  46.03 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2837  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.44 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.23809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3755  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  40.75 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02010  magnesium Mg(2+) and cobalt Co(2+) transport protein CorA  36.14 
 
 
361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.14 
 
 
325 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.34 
 
 
368 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.26 
 
 
367 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.79 
 
 
324 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2538  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.26 
 
 
390 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.53 
 
 
357 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.88 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  38.08 
 
 
372 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  34.72 
 
 
363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1876  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.23 
 
 
361 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.62 
 
 
391 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.2 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.42 
 
 
365 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  36 
 
 
374 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.78 
 
 
436 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  34.62 
 
 
360 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.64 
 
 
321 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.2 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.2 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3065  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  37.16 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.2 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.12 
 
 
323 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.04 
 
 
321 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  35 
 
 
365 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2624  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.26 
 
 
323 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  32.48 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.87 
 
 
322 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.92 
 
 
324 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.42 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.42 
 
 
323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.34 
 
 
358 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1832  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.56 
 
 
346 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.31 
 
 
417 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  34.11 
 
 
366 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3541  Mg2+ transporter protein, CorA-like  31.48 
 
 
324 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.6 
 
 
326 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.89 
 
 
325 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  34.3 
 
 
323 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.89 
 
 
325 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.14 
 
 
326 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  33.11 
 
 
321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  34.34 
 
 
337 aa  152  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.68 
 
 
337 aa  152  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.09 
 
 
325 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.09 
 
 
325 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.09 
 
 
325 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.57 
 
 
367 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.72 
 
 
325 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.12 
 
 
325 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.12 
 
 
325 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.12 
 
 
325 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  31.03 
 
 
325 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13880  Mg2+/Co2+ transporter  33.11 
 
 
330 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00247267  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.28 
 
 
325 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.13 
 
 
322 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.72 
 
 
325 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.43 
 
 
339 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.92 
 
 
322 aa  150  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.12 
 
 
339 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.11 
 
 
340 aa  150  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.78 
 
 
325 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.01 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.62 
 
 
325 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.21 
 
 
321 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  30.38 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.79 
 
 
355 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.8 
 
 
357 aa  143  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  32.72 
 
 
333 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.24 
 
 
325 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  28.38 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0881  putative metal ion transporter  30.15 
 
 
345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4998  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.54 
 
 
381 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442957  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.66 
 
 
353 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1843  Mg2+/Co2+ transporter  32.82 
 
 
323 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4484  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.55 
 
 
382 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00540479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1421  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.2 
 
 
323 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3867  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  32.82 
 
 
323 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.88 
 
 
341 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0841  Mg2+ transporter protein, CorA-like  34.78 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.66 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0642  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.99 
 
 
327 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1452  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.27 
 
 
323 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.786219  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  30.24 
 
 
358 aa  135  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0098  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  29.01 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194887  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0674  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.34 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.06 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.61 
 
 
354 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>