More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2538 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2538  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
390 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  42.5 
 
 
384 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.37 
 
 
378 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6428  magnesium/cobalt transporter CorA  41.29 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.9 
 
 
331 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.75 
 
 
380 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.16 
 
 
370 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.23 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.08 
 
 
331 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.75 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3755  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  40.32 
 
 
338 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2837  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.68 
 
 
338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.23809 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02010  magnesium Mg(2+) and cobalt Co(2+) transport protein CorA  37.67 
 
 
361 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1876  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.85 
 
 
361 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.89 
 
 
367 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.21 
 
 
357 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  33.76 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.75 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.95 
 
 
417 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.15 
 
 
323 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.15 
 
 
323 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.87 
 
 
365 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28210  Mg2+/Co2+ transporter  35.26 
 
 
371 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.34 
 
 
325 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.06 
 
 
358 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.5 
 
 
374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.24 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  33.42 
 
 
323 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.51 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2624  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.91 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.04 
 
 
365 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  35.19 
 
 
366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.43 
 
 
326 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  33.62 
 
 
372 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.83 
 
 
360 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.89 
 
 
353 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.89 
 
 
353 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.89 
 
 
353 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.44 
 
 
325 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.6 
 
 
323 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
325 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
325 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
325 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.62 
 
 
325 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.22 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1832  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.42 
 
 
346 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.89 
 
 
325 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.35 
 
 
325 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.7 
 
 
326 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  28.53 
 
 
325 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.17 
 
 
391 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.35 
 
 
325 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3065  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  35.24 
 
 
318 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.35 
 
 
325 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.87 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  29.04 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  30.62 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  29.81 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.14 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.77 
 
 
321 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.32 
 
 
321 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.7 
 
 
325 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4484  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.07 
 
 
382 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00540479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.05 
 
 
322 aa  159  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0485  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.97 
 
 
322 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4998  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.9 
 
 
381 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442957  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.45 
 
 
325 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.67 
 
 
321 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.88 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  27.61 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  27.67 
 
 
321 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0642  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.19 
 
 
327 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.07 
 
 
324 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.05 
 
 
340 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0674  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.73 
 
 
404 aa  149  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0881  putative metal ion transporter  29.23 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13880  Mg2+/Co2+ transporter  29.3 
 
 
330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00247267  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3541  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.63 
 
 
324 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1421  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.15 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1843  Mg2+/Co2+ transporter  29.45 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3867  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  29.45 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1813  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.07 
 
 
367 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.406453  normal  0.0884578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.57 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2140  magnesium/cobalt transporter CorA  28.14 
 
 
323 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5093  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.17 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  hitchhiker  0.0090718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1452  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.57 
 
 
323 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.786219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.46 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2064  magnesium and cobalt transport protein, putative  27.57 
 
 
323 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00816438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.09 
 
 
339 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.57 
 
 
339 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.38 
 
 
322 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1874  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.03 
 
 
323 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5376  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.2 
 
 
347 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.904617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1742  Mg2+ transporter protein, CorA-like  25.34 
 
 
323 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.32 
 
 
367 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  27.32 
 
 
330 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0841  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.05 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>