More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0036 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  100 
 
 
360 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  80.19 
 
 
323 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  61.92 
 
 
323 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  61.3 
 
 
323 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  61.3 
 
 
323 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  56.88 
 
 
326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.72 
 
 
337 aa  308  8e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  44.72 
 
 
337 aa  308  9e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1347  Mg2 transporter protein CorA family protein  45.79 
 
 
340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  45.65 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2140  magnesium/cobalt transporter CorA  42.86 
 
 
323 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  42.11 
 
 
321 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1813  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.96 
 
 
367 aa  292  6e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.406453  normal  0.0884578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0642  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.28 
 
 
327 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0674  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.39 
 
 
404 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.77 
 
 
322 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.03 
 
 
321 aa  285  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.98 
 
 
325 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.83 
 
 
325 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.83 
 
 
325 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3541  Mg2+ transporter protein, CorA-like  42.72 
 
 
324 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.52 
 
 
325 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.03 
 
 
325 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.52 
 
 
325 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1081  magnesium/cobalt transporter CorA  43.12 
 
 
321 aa  278  9e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99494  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  41.67 
 
 
325 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.52 
 
 
325 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.52 
 
 
325 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.52 
 
 
325 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.02 
 
 
324 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.52 
 
 
325 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0881  putative metal ion transporter  43.3 
 
 
345 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.59 
 
 
325 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.59 
 
 
325 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.52 
 
 
325 aa  275  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  42.59 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  42.9 
 
 
325 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5093  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.96 
 
 
347 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  hitchhiker  0.0090718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.44 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5376  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.65 
 
 
347 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.904617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.38 
 
 
325 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7673  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.77 
 
 
334 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.690652  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.01 
 
 
322 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1910  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.41 
 
 
334 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1421  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.39 
 
 
323 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1843  Mg2+/Co2+ transporter  38.08 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3867  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  38.08 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  39.53 
 
 
372 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2064  magnesium and cobalt transport protein, putative  37.46 
 
 
323 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00816438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1742  Mg2+ transporter protein, CorA-like  37.46 
 
 
323 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1452  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.08 
 
 
323 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.786219  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.79 
 
 
358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.58 
 
 
368 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  36.53 
 
 
363 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1874  Mg2+ transporter protein, CorA-like  36.53 
 
 
323 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.27 
 
 
323 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.65 
 
 
322 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.89 
 
 
321 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.4 
 
 
353 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.2 
 
 
365 aa  235  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.4 
 
 
353 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.4 
 
 
353 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.13 
 
 
365 aa  232  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1428  magnesium/cobalt transporter CorA  37.83 
 
 
384 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.06 
 
 
367 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0113  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.36 
 
 
378 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453825  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  37.01 
 
 
366 aa  229  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4111  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.86 
 
 
417 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.79 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.09 
 
 
324 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2624  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.77 
 
 
323 aa  223  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1876  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.16 
 
 
361 aa  222  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4484  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.27 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00540479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.14 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0841  Mg2+ transporter protein, CorA-like  38.24 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.09 
 
 
374 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.25 
 
 
331 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4998  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.53 
 
 
381 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442957  hitchhiker  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.44 
 
 
370 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.31 
 
 
357 aa  212  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.84 
 
 
331 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0126  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.09 
 
 
322 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000115284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.19 
 
 
380 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0098  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  32.4 
 
 
322 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194887  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3755  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  36.87 
 
 
338 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6428  magnesium/cobalt transporter CorA  35.81 
 
 
380 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.5 
 
 
375 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.79 
 
 
358 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2837  Mg2 transporter protein CorA family protein  36.09 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.23809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13880  Mg2+/Co2+ transporter  34.44 
 
 
330 aa  190  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00247267  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.61 
 
 
322 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.8 
 
 
339 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1832  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.68 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2538  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.83 
 
 
390 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.89 
 
 
391 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.85 
 
 
339 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02010  magnesium Mg(2+) and cobalt Co(2+) transport protein CorA  31.13 
 
 
361 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28210  Mg2+/Co2+ transporter  34.62 
 
 
371 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.68 
 
 
321 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.02 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>