More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0943 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0943  Mg2 transporter protein, CorA family protein  100 
 
 
322 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0789  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.02 
 
 
322 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.957399  normal  0.0628578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.9 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.02 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.3 
 
 
339 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.19 
 
 
375 aa  122  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.05 
 
 
339 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.17 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.92 
 
 
372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  27.72 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  27.72 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.46 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  23.31 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  27.72 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.8 
 
 
321 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
320 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
316 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
316 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.48 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.84 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.12 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.07 
 
 
352 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.46 
 
 
351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.12 
 
 
351 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.32 
 
 
352 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.86 
 
 
348 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.37 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.71 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.46 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.56 
 
 
352 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.17 
 
 
322 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.78 
 
 
374 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.55 
 
 
383 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.17 
 
 
353 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.12 
 
 
353 aa  106  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  25.64 
 
 
354 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.84 
 
 
354 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.21 
 
 
354 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.85 
 
 
355 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.65 
 
 
355 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.99 
 
 
387 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  24.58 
 
 
363 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.03 
 
 
357 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  25.34 
 
 
354 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  25.08 
 
 
380 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.18 
 
 
353 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.08 
 
 
390 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.56 
 
 
376 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  25 
 
 
354 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.68 
 
 
385 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.42 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.6 
 
 
354 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.68 
 
 
385 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.94 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2417  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.56 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.47 
 
 
354 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.47 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.17 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2371  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.56 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.563119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  23.77 
 
 
365 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1735  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.24 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942891  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2565  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.6 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.52 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.09 
 
 
356 aa  94  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0150  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  24.83 
 
 
345 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.17 
 
 
353 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.79 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.72 
 
 
372 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.08 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.95 
 
 
354 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.25 
 
 
357 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.68 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1938  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.83 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.67 
 
 
367 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.15 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4182  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.83 
 
 
381 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4221  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.83 
 
 
381 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.51 
 
 
325 aa  90.1  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1034  magnesium and cobalt transporter, putative  23.93 
 
 
310 aa  89.7  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00652264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.66 
 
 
368 aa  89  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1928  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.77 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.06 
 
 
379 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3786  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  25.33 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.14 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.69 
 
 
353 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.69 
 
 
353 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.69 
 
 
353 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.97 
 
 
547 aa  86.7  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.71 
 
 
374 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  45 
 
 
357 aa  85.9  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.26 
 
 
358 aa  85.9  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3755  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.56 
 
 
338 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  24.27 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.5 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1958  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.27 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000232842  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0106  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.35 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000184046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>