More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0373 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0373  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
360 aa  736    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0305  transport protein  65.75 
 
 
366 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0244  Mg2+ transporter protein, CorA-like  61.11 
 
 
371 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0191  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  58.73 
 
 
371 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.503449  normal  0.774114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0379  Mg2 transporter protein CorA family protein  56.35 
 
 
397 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3806  Mg2+ transporter protein, CorA-like  59.1 
 
 
412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000191662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0326  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  53.52 
 
 
409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4927  Mg2 transporter protein CorA family protein  54.57 
 
 
386 aa  394  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0109111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0260  Mg2 transporter protein CorA family protein  54.38 
 
 
401 aa  391  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.206311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0265  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  54.38 
 
 
401 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0389  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  54.99 
 
 
375 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3150  Mg2+ transporter protein, CorA-like  41.48 
 
 
396 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3287  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  43.58 
 
 
393 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.24 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.78 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.45 
 
 
376 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.64 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.82 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.82 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  35 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.42 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.24 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.14 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.8 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.8 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.97 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.05 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2417  Mg2 transporter protein CorA family protein  22.82 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2371  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  22.82 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.563119  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1735  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.61 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942891  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.24 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.31 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.98 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.03 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.62 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.96 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  24.19 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  19.7 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3204  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.74 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648086  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.45 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.65 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.59 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.07 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.08 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.7 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  23.61 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1938  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.95 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.77 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.41 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.67 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.77 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.27 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.36 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.41 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  20 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.37 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  20 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.74 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  31.58 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0150  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  26.04 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  20 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  19.59 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  19.59 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  19.59 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  19.59 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.56 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  19.59 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.45 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0789  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  36.36 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.957399  normal  0.0628578 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.21 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.1 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  23.75 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  23 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.48 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.84 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.78 
 
 
547 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  19.39 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  23.75 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  25 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.99 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.29 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28210  Mg2+/Co2+ transporter  25.87 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.38 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.71 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0263  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.11 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990966  normal  0.524479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.9 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.12 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.43 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.8 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0489  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.82 
 
 
383 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0800  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  35.92 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2424  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.68 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1207  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.04 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.110395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.05 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.26 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3786  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  25.3 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  25.37 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1262  putative cation transporter  28.57 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0115831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>