More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3287 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3287  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  100 
 
 
393 aa  793    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3150  Mg2+ transporter protein, CorA-like  79.55 
 
 
396 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3806  Mg2+ transporter protein, CorA-like  42.53 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000191662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0326  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  38.54 
 
 
409 aa  242  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0191  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  41.62 
 
 
371 aa  243  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.503449  normal  0.774114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0244  Mg2+ transporter protein, CorA-like  41.91 
 
 
371 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0379  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.18 
 
 
397 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0373  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.58 
 
 
360 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4927  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.72 
 
 
386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0109111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0305  transport protein  40.05 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0260  Mg2 transporter protein CorA family protein  40.17 
 
 
401 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.206311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0265  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  40.06 
 
 
401 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0389  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  43.4 
 
 
375 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.85 
 
 
353 aa  99  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.8 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.75 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  19.77 
 
 
352 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2267  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.2 
 
 
360 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0974553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.93 
 
 
354 aa  89.7  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.31 
 
 
354 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.13 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.58 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.17 
 
 
354 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1997  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.39 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.223184  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2417  Mg2 transporter protein CorA family protein  19.94 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2371  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  19.94 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.563119  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2170  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.86 
 
 
372 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.574954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.35 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0789  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  37.04 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.957399  normal  0.0628578 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.51 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  25.49 
 
 
358 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.36 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.3 
 
 
351 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.65 
 
 
351 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4191  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.75 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.259759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.69 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0556  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.18 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2608  Mg2+/Co2+ transporter  27.92 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1266  Fis family transcriptional regulator  27.92 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  20.87 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.94 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.04 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0943  Mg2 transporter protein, CorA family protein  39.78 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  22.08 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0969  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.71 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231272  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.77 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.18 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2374  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.28 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.38 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.53 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.08 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0003  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.72 
 
 
317 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00000548112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  36 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.83 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.73 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.06 
 
 
327 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1576  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.32 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.547991  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.04 
 
 
357 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.76 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.61 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3288  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.57 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1735  Mg2 transporter protein CorA family protein  24.01 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942891  hitchhiker  0.00692573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0137  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.3 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.56 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  37 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  26.67 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2333  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.13 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.84 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.02 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3190  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.91 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3786  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.74 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.68 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.99 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2837  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.57 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  34.38 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.56 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.78 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.01 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  25.24 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.59 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.61 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.11 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.88 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.37 
 
 
316 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.37 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.37 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.04 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.04 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3541  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.27 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1262  putative cation transporter  36.62 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0115831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.37 
 
 
316 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  25.37 
 
 
316 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  25.37 
 
 
316 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  27.6 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  25.37 
 
 
320 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2080  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.53 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0150  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  35.79 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.37 
 
 
316 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0800  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  35.29 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.17 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>