132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4365 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  95.4 
 
 		 329 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  100 
 
 		 329 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  86.12 
 
 		 329 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  86.03 
 
 		 328 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  82.62 
 
 		 330 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  82.76 
 
 		 322 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  79.38 
 
 		 327 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  69.77 
 
 		 338 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  70.79 
 
 		 325 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  67.2 
 
 		 334 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  66.98 
 
 		 343 aa  461  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  67.94 
 
 		 329 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  67.3 
 
 		 331 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  66.98 
 
 		 331 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  66.67 
 
 		 332 aa  454  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  67.85 
 
 		 318 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  66.98 
 
 		 327 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  66.67 
 
 		 331 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  66.77 
 
 		 331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  66.35 
 
 		 332 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  65.93 
 
 		 328 aa  447  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  64.89 
 
 		 335 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  67.2 
 
 		 327 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  65.19 
 
 		 328 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  64.8 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  64.67 
 
 		 327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  64.78 
 
 		 327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  66.24 
 
 		 327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  65.92 
 
 		 327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  64.49 
 
 		 364 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  64.49 
 
 		 364 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  64.71 
 
 		 331 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  65.38 
 
 		 331 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  65.27 
 
 		 327 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  65.51 
 
 		 332 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  65.81 
 
 		 328 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  65.29 
 
 		 326 aa  438  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  64.74 
 
 		 330 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  65.81 
 
 		 328 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  65.27 
 
 		 327 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  66.45 
 
 		 330 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  63.75 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  65.8 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  65.06 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  65.08 
 
 		 324 aa  435  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  64.58 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  64.74 
 
 		 330 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  63.84 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  65.38 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  62.87 
 
 		 328 aa  426  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  36.33 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  36.9 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  32.5 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  30.41 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.41 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  29.57 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.17 
 
 		 314 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  31.2 
 
 		 306 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  32.46 
 
 		 324 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  27.13 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  28.8 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  26.81 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  28.93 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  28.93 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.24 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  26.3 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  24.33 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  31.82 
 
 		 4917 aa  73.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  25.23 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  30.2 
 
 		 4979 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  23.9 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  27.59 
 
 		 4844 aa  63.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  23.74 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.52 
 
 		 278 aa  57  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  28.77 
 
 		 265 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  28.91 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  26.01 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1368  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.73 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000052679  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.32 
 
 		 373 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  24.03 
 
 		 272 aa  52.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  29.05 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  29.05 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  26.34 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  24.45 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  26.42 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.92 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.27 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  26.53 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  25.94 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  25.61 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  25.71 
 
 		 268 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.74 
 
 		 855 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0058  gas vesicle protein GvpN  25.83 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0714681  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  25.96 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  23.42 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  27.34 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  27.5 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  26.36 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.13 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  25.71 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>