174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3230 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  93.27 
 
 
327 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  99.39 
 
 
327 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  96.94 
 
 
327 aa  656    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  100 
 
 
327 aa  675    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  89.3 
 
 
327 aa  617  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  88.69 
 
 
327 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.87 
 
 
332 aa  580  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.57 
 
 
327 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  83.28 
 
 
332 aa  570  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.21 
 
 
334 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.04 
 
 
331 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  83.96 
 
 
318 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  83.02 
 
 
331 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.7 
 
 
331 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.39 
 
 
331 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  80.86 
 
 
343 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  79.82 
 
 
332 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.25 
 
 
328 aa  560  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  81.25 
 
 
328 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  81.25 
 
 
328 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.13 
 
 
331 aa  552  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  82.19 
 
 
330 aa  550  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.25 
 
 
330 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  80.94 
 
 
330 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  79.69 
 
 
331 aa  544  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  75.63 
 
 
364 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  75.16 
 
 
328 aa  520  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.39 
 
 
364 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.71 
 
 
345 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  74.69 
 
 
329 aa  507  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  74.13 
 
 
327 aa  505  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  71.65 
 
 
329 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  74.05 
 
 
328 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  73.52 
 
 
334 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  73.58 
 
 
335 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  73.73 
 
 
338 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.35 
 
 
330 aa  487  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  72.93 
 
 
329 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  70.9 
 
 
328 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  73.08 
 
 
324 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  73.23 
 
 
326 aa  478  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  73.53 
 
 
343 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  67.74 
 
 
327 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  67.82 
 
 
328 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  67.92 
 
 
330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  68.39 
 
 
329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  65.71 
 
 
329 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  65.92 
 
 
329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  66.45 
 
 
322 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  64.82 
 
 
325 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  36.78 
 
 
409 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  30.43 
 
 
322 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  35.68 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  36.36 
 
 
315 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  27.67 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.29 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  31.29 
 
 
307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  29.12 
 
 
411 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  31.62 
 
 
306 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  32.45 
 
 
313 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  28.91 
 
 
324 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.06 
 
 
314 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  28.2 
 
 
338 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  27.54 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  25.16 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.92 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  27.07 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  24.62 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  25.84 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.08 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  27.02 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  32.26 
 
 
4917 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  30.82 
 
 
4979 aa  65.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.85 
 
 
267 aa  63.9  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.96 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  31.21 
 
 
4844 aa  63.2  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.4 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.96 
 
 
267 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  26.7 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  26.9 
 
 
284 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  24.71 
 
 
263 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  25.46 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  25.82 
 
 
267 aa  59.7  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  25.68 
 
 
272 aa  59.3  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  25.46 
 
 
267 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  32.81 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  32.81 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  25.98 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  24.47 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  27.27 
 
 
279 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  22.18 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  25 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.47 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  32.81 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23838  predicted protein  25.7 
 
 
1879 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.2 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.46 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.86 
 
 
295 aa  57  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  25.46 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  26.54 
 
 
279 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>