241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3615 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  100 
 
 		 280 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  67.31 
 
 		 271 aa  359  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  63.12 
 
 		 267 aa  355  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  63.85 
 
 		 267 aa  353  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  60.87 
 
 		 307 aa  350  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  61.98 
 
 		 267 aa  349  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  64.5 
 
 		 268 aa  348  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  62.4 
 
 		 267 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  63.74 
 
 		 266 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  63.08 
 
 		 268 aa  343  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  59.85 
 
 		 278 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  59.47 
 
 		 267 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  59.47 
 
 		 267 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  60.61 
 
 		 267 aa  339  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  60.61 
 
 		 267 aa  339  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  60 
 
 		 285 aa  339  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  62.31 
 
 		 269 aa  337  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  62.45 
 
 		 268 aa  336  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  58.94 
 
 		 272 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  58.94 
 
 		 272 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  60.54 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  58.4 
 
 		 267 aa  334  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  59.54 
 
 		 267 aa  331  7.000000000000001e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  56.98 
 
 		 266 aa  328  4e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  60.84 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  58.4 
 
 		 268 aa  324  8.000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  58.17 
 
 		 266 aa  321  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  59.45 
 
 		 265 aa  318  9e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  61.07 
 
 		 279 aa  315  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  59.23 
 
 		 272 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  61.18 
 
 		 265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  57.04 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  55.09 
 
 		 279 aa  296  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.33 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  59.06 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  53.88 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.66 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.51 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  55.51 
 
 		 260 aa  279  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  55.34 
 
 		 260 aa  275  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  54.91 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  47.5 
 
 		 285 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  54.81 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  53.88 
 
 		 271 aa  270  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.63 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  55.51 
 
 		 275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  46.01 
 
 		 280 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  52.63 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  58.51 
 
 		 277 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  53.52 
 
 		 270 aa  268  8.999999999999999e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  54.47 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  56.52 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  56.52 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.69 
 
 		 271 aa  265  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  55.02 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  55.16 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  55.02 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  53.73 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  54.9 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  54.58 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  54.58 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  54.9 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  54.58 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  54.9 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  53.17 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  58.16 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  53.97 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.8 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.97 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  52.14 
 
 		 270 aa  251  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  51.57 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  51.18 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  53.57 
 
 		 273 aa  249  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  55.12 
 
 		 270 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  49.62 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  49.19 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  49.39 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  47.62 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  47.62 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  47.22 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.52 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  27.8 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  28.51 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  28.51 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  29.84 
 
 		 4917 aa  95.5  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  28.95 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.52 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6855  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.85 
 
 		 430 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00217466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  28.51 
 
 		 297 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  28.51 
 
 		 297 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  28.51 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  28.51 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  28.51 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  28.51 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  28.51 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  28.51 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  27.75 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  28.07 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.05 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6734  ATPase  31.56 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0140161  normal  0.0815898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>