190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1877 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  100 
 
 
327 aa  677    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  85.63 
 
 
332 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  87.7 
 
 
318 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  84.76 
 
 
332 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  83.08 
 
 
331 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  84.52 
 
 
331 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  84.21 
 
 
331 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.57 
 
 
327 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  84.38 
 
 
327 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.9 
 
 
328 aa  574  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.57 
 
 
327 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  82.21 
 
 
328 aa  570  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.96 
 
 
331 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.26 
 
 
327 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  82.21 
 
 
328 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.96 
 
 
327 aa  567  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  83.23 
 
 
327 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  82.24 
 
 
343 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.92 
 
 
330 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.68 
 
 
332 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.08 
 
 
334 aa  557  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.3 
 
 
330 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.5 
 
 
331 aa  557  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  81.68 
 
 
330 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  78.16 
 
 
328 aa  537  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  77.36 
 
 
331 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  70.68 
 
 
334 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  71.29 
 
 
364 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  73.55 
 
 
329 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  73.67 
 
 
330 aa  491  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  71.29 
 
 
364 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  71.12 
 
 
345 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  70.81 
 
 
329 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  71.92 
 
 
328 aa  488  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  71.92 
 
 
327 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  72.05 
 
 
335 aa  484  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  73.38 
 
 
338 aa  480  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  70.35 
 
 
329 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  71.34 
 
 
328 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  70.48 
 
 
326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  71.66 
 
 
343 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  70.42 
 
 
324 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  67.52 
 
 
328 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  66.56 
 
 
329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  67.74 
 
 
327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  66.88 
 
 
322 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  65.55 
 
 
330 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  64.78 
 
 
329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  65.4 
 
 
329 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  65.08 
 
 
325 aa  424  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  37.01 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  30.84 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  29.1 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  36.21 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  37.14 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  33.57 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.08 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  32.08 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  31.73 
 
 
411 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  31.72 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  29.04 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.81 
 
 
314 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  28.03 
 
 
338 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  27.39 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.65 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  26.69 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  24.43 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  25.26 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  23.87 
 
 
324 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.27 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  28.98 
 
 
4917 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  27.08 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  30.34 
 
 
4979 aa  63.2  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  26.4 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.46 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  27.96 
 
 
4844 aa  60.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  24.66 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  32.03 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.02 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  32.03 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  25.49 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  23.55 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  23.94 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  25.64 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  23.64 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  22.69 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  23.61 
 
 
307 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3031  gas vesicle protein GvpN  25.26 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  21.94 
 
 
267 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  21.94 
 
 
267 aa  55.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  27.03 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  22.83 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.56 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  28.29 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  24.56 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  26.44 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  22.94 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  22.94 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>