118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0108 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  100 
 
 		 411 aa  854    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.5 
 
 		 331 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.93 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.34 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  32.01 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.99 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.73 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  34.47 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.39 
 
 		 330 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  35.78 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  30.77 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  30.14 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  33.06 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.77 
 
 		 307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.79 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.39 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.12 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  30.14 
 
 		 328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  35.32 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.12 
 
 		 327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.85 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.52 
 
 		 331 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.12 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.62 
 
 		 327 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  35.43 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.77 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.14 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.33 
 
 		 332 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.68 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.68 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.68 
 
 		 343 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  31.73 
 
 		 328 aa  111  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.52 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30 
 
 		 331 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.33 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  30.56 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  36.03 
 
 		 306 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.92 
 
 		 331 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.52 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.52 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.73 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.38 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.45 
 
 		 329 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.2 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  31.5 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.2 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  31.56 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  29.48 
 
 		 328 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.48 
 
 		 329 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.88 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.72 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.72 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.62 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  30.24 
 
 		 322 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  28.8 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.4 
 
 		 329 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.92 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  28.8 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  30.4 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.48 
 
 		 314 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  29.32 
 
 		 330 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  27.71 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  29.71 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  29.9 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.08 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  34.16 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  28.5 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  26.94 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.24 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  28.51 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  27.02 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.7 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  26.69 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  25.69 
 
 		 271 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  26.26 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  26.07 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  26.07 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  26.07 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  26.07 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  26.07 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  26.07 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  25.54 
 
 		 297 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  25.71 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  25.71 
 
 		 297 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.85 
 
 		 855 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.9 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  24.86 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  23.11 
 
 		 263 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  23.11 
 
 		 263 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1815  gas vesicle protein GvpN  20.94 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  26.22 
 
 		 266 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  25.23 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  25.93 
 
 		 280 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.29 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1368  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 301 aa  47  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000052679  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  27.87 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  21.46 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1255  gas vesicle protein GvpN  23.64 
 
 		 334 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  21.66 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  24.63 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>