202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0106 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  100 
 
 		 322 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  53.18 
 
 		 321 aa  351  8.999999999999999e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.26 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  48.26 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  47.22 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  46.26 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  45.92 
 
 		 338 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  41.05 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  37.17 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.06 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.66 
 
 		 373 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  31.55 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  30.19 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.84 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.19 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.43 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.22 
 
 		 331 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  29.65 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.06 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  34.39 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.75 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.31 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.38 
 
 		 343 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  29.34 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.69 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.34 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.03 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.38 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  32.88 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.25 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.43 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.43 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.63 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.68 
 
 		 331 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.45 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.35 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.82 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.19 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  29.2 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.91 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.7 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.7 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.91 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  29.01 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.7 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.62 
 
 		 335 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  32.06 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.69 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  27.21 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  29.69 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.72 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.79 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.41 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.01 
 
 		 338 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  29.65 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.09 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.96 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  29.03 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.33 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  29.57 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  26.87 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  26.62 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  28.87 
 
 		 325 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  33.07 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  32.42 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  30.24 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.63 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  32.54 
 
 		 400 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  29.08 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  32.88 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0394  cobalamin biosynthesis CobS-like protein  27.91 
 
 		 375 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313111  hitchhiker  0.00145489 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.51 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  31.41 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  31.41 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  27.23 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  28.84 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.03 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.19 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  26.98 
 
 		 4844 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  28.46 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  28.08 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.38 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.34 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  28.38 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  27.19 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  28.88 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  28.02 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  30.42 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  26.94 
 
 		 4979 aa  69.7  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  30.42 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  27.63 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.4 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.7 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.8 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  27.27 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.45 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.83 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  27.45 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>