221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0222 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  100 
 
 
330 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  78.34 
 
 
329 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.55 
 
 
338 aa  508  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.32 
 
 
331 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  76.23 
 
 
343 aa  505  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.8 
 
 
331 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  76.34 
 
 
330 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.53 
 
 
332 aa  501  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.39 
 
 
327 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75 
 
 
331 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.68 
 
 
331 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  76.3 
 
 
318 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  76.03 
 
 
330 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.68 
 
 
328 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  74.68 
 
 
328 aa  494  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.16 
 
 
332 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  72.12 
 
 
326 aa  494  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  75.56 
 
 
343 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.76 
 
 
327 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.45 
 
 
331 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  74.68 
 
 
328 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  73.48 
 
 
330 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.84 
 
 
332 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  72.93 
 
 
345 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  73.67 
 
 
327 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  72.61 
 
 
364 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.13 
 
 
331 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  72.38 
 
 
364 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.68 
 
 
327 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75 
 
 
327 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.08 
 
 
334 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  71.97 
 
 
329 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  72.06 
 
 
328 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  73.25 
 
 
327 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.35 
 
 
327 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.68 
 
 
327 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  73.02 
 
 
324 aa  481  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  72.73 
 
 
328 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  71.75 
 
 
334 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  71.3 
 
 
335 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  69.33 
 
 
329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  70.36 
 
 
328 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  70.68 
 
 
329 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  69.5 
 
 
328 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  67.75 
 
 
327 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  67.74 
 
 
322 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  66.56 
 
 
330 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  66.78 
 
 
329 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  66.45 
 
 
329 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  69.38 
 
 
325 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  30 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  36.61 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  34.25 
 
 
315 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  29.41 
 
 
321 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  30.39 
 
 
411 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  33.33 
 
 
400 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.56 
 
 
307 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  30.56 
 
 
307 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  31.44 
 
 
313 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  33.02 
 
 
306 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  27.39 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  28.1 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  26.56 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.04 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.13 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  28.2 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  27.31 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  27.06 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  30.68 
 
 
4917 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  31.72 
 
 
4979 aa  69.7  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.11 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  31.06 
 
 
4844 aa  66.2  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.89 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  28.9 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  24.02 
 
 
267 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  24.4 
 
 
330 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  25.93 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  24.02 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.97 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.19 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.62 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.23 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  26.23 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.32 
 
 
267 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  24.47 
 
 
307 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  24.22 
 
 
263 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  20.75 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.29 
 
 
855 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  26.83 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  24.47 
 
 
278 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.64 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  24.64 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  20.75 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  20.75 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1750  gas vesicle protein GvpN  30.57 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  20.75 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  20.75 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  20.75 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  20.75 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  20.75 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>