188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2022 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 328 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  96.95 
 
 		 328 aa  663    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  99.39 
 
 		 328 aa  676    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  88.72 
 
 		 343 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  87.16 
 
 		 331 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  86.32 
 
 		 330 aa  590  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  85.41 
 
 		 330 aa  590  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  85.41 
 
 		 330 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.21 
 
 		 327 aa  570  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.99 
 
 		 331 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.5 
 
 		 332 aa  567  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  83.33 
 
 		 327 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  83.65 
 
 		 332 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.79 
 
 		 327 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  80.75 
 
 		 331 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  80.5 
 
 		 331 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  82.19 
 
 		 327 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  82.39 
 
 		 318 aa  560  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.56 
 
 		 327 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  80.25 
 
 		 332 aa  555  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.56 
 
 		 327 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  80.62 
 
 		 331 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.25 
 
 		 327 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  81.5 
 
 		 334 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  80.5 
 
 		 328 aa  552  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  79.69 
 
 		 331 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.16 
 
 		 335 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.68 
 
 		 330 aa  494  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  72.59 
 
 		 364 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  74.36 
 
 		 329 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  72.67 
 
 		 328 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  72.59 
 
 		 364 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  72.59 
 
 		 345 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.48 
 
 		 338 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  71.66 
 
 		 334 aa  494  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  73.19 
 
 		 329 aa  491  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  74.44 
 
 		 327 aa  491  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  73.23 
 
 		 329 aa  481  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  71.25 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  73.48 
 
 		 324 aa  478  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  71.38 
 
 		 343 aa  477  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  71.88 
 
 		 326 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  67.85 
 
 		 329 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  67.2 
 
 		 328 aa  447  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  66.99 
 
 		 322 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  68.08 
 
 		 330 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  66.14 
 
 		 327 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  65.81 
 
 		 329 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  65.8 
 
 		 329 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  65.47 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  36.33 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  37.14 
 
 		 409 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  29.34 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  35.63 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  28.71 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  32.49 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.89 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  30.89 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  30.14 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  28.53 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  29.81 
 
 		 338 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  32.1 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  29.17 
 
 		 338 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  27.76 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.42 
 
 		 314 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  26.92 
 
 		 317 aa  95.9  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.54 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.17 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  26.04 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  30.3 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  25.85 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  25.32 
 
 		 4844 aa  66.2  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  28.41 
 
 		 4917 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.42 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  26.77 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  30.5 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  24.24 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25.25 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  24.02 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  29.73 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.24 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  24.24 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.75 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  34.65 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  34.65 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  24.24 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  25.79 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  28.28 
 
 		 4979 aa  60.1  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.75 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  24.75 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.95 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.95 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  26.34 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  23.74 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  21.76 
 
 		 301 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  23.33 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  23.33 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  24.75 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  31.25 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.74 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>