166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1713 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  100 
 
 		 331 aa  690    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  79.69 
 
 		 328 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  80 
 
 		 327 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  79.69 
 
 		 327 aa  544  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  79.81 
 
 		 343 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  79.69 
 
 		 327 aa  544  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  79.69 
 
 		 328 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  79.31 
 
 		 331 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  79.62 
 
 		 327 aa  540  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  78.68 
 
 		 318 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  78.75 
 
 		 328 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  79.31 
 
 		 327 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  78.93 
 
 		 331 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  78.06 
 
 		 331 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  77.33 
 
 		 332 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  77.74 
 
 		 331 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  79 
 
 		 327 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  78.62 
 
 		 331 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  78.93 
 
 		 330 aa  531  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  77.43 
 
 		 332 aa  531  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  78.86 
 
 		 334 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  78.55 
 
 		 330 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  78.37 
 
 		 332 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  77.36 
 
 		 327 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  78.23 
 
 		 330 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  78.27 
 
 		 329 aa  521  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  78.14 
 
 		 338 aa  521  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  76.42 
 
 		 335 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  75.48 
 
 		 364 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  74.84 
 
 		 328 aa  511  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.48 
 
 		 364 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  77.27 
 
 		 343 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  74.13 
 
 		 345 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  74.14 
 
 		 334 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.8 
 
 		 330 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  72.64 
 
 		 329 aa  497  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  72.96 
 
 		 328 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  74.52 
 
 		 328 aa  500  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  72.84 
 
 		 324 aa  494  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  72.76 
 
 		 327 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  75.48 
 
 		 326 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  75.24 
 
 		 329 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  67.2 
 
 		 327 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  67.64 
 
 		 322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  68.06 
 
 		 329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  68.51 
 
 		 328 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  65.38 
 
 		 329 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  65.81 
 
 		 329 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  65.91 
 
 		 330 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  66.88 
 
 		 325 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  36.02 
 
 		 409 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  30.82 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  34.44 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  35.27 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  28.53 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  29.52 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.52 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  30 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  31.25 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  27.81 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  27.87 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  27.21 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.95 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  28.9 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.39 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  25.71 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  26.6 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  25.71 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  26.28 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  30.32 
 
 		 4917 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  31.45 
 
 		 4979 aa  65.9  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.41 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.33 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  31.43 
 
 		 4844 aa  63.9  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  25 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  21.76 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.71 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.2 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  24.71 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.33 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  28.67 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  28.91 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  28.67 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  27.7 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  24.04 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  24.04 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  23.41 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  25.33 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  26.56 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  24.08 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  25.35 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23838  predicted protein  24.3 
 
 		 1879 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  30.47 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  25.66 
 
 		 272 aa  53.5  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1264  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.54 
 
 		 855 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.67 
 
 		 267 aa  52.8  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  23.94 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  22.65 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  23.33 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.05 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>