204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2872 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 314 aa  647    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  40.21 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.21 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  35.95 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  35.44 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  36.49 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  36.15 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  34.06 
 
 		 322 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  33.57 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  32.78 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  29.12 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  30.8 
 
 		 317 aa  119  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  27.39 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.81 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.81 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  33.46 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.51 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  27.42 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.17 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.32 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.3 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.92 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.53 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.06 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  27.42 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  29.17 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.54 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  27.76 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.68 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.32 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  27.57 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.39 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.3 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.7 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.15 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.68 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.97 
 
 		 329 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  29.55 
 
 		 330 aa  99  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  30.57 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.68 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.41 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.41 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.53 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.9 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.95 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.76 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  30.43 
 
 		 409 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.19 
 
 		 328 aa  95.5  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.16 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.28 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  30.37 
 
 		 400 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  33.48 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  27 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  30.25 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.46 
 
 		 334 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.84 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  27.99 
 
 		 330 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  28.79 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  25.08 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.12 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  25.16 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  31.13 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.68 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.68 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  32 
 
 		 4917 aa  82.4  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.94 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.61 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.17 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  25.25 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.62 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  30.54 
 
 		 4979 aa  79.3  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  26.42 
 
 		 4844 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.44 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.81 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  26.75 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.55 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  27.07 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.55 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.93 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.31 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  25.65 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  27.03 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  27.51 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.74 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  27.04 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.48 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  25.13 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  27.59 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  26.83 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  25.6 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  27.75 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  25.87 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0394  cobalamin biosynthesis CobS-like protein  23.68 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313111  hitchhiker  0.00145489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  26.42 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  26.42 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1368  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.99 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000052679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  29.03 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0330  hypothetical protein  28.1 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.608164 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.17 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  29.63 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>