258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3766 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  100 
 
 
268 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  76.47 
 
 
272 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  76.47 
 
 
272 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  74.63 
 
 
268 aa  418  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  77.25 
 
 
265 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  73.38 
 
 
267 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  71.86 
 
 
267 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  73.56 
 
 
266 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  71.48 
 
 
267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  71.48 
 
 
267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  75.29 
 
 
268 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  73 
 
 
271 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  71.48 
 
 
267 aa  397  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  68.06 
 
 
267 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  68.44 
 
 
267 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  67.42 
 
 
266 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  67.42 
 
 
267 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  70.5 
 
 
278 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  67.42 
 
 
267 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  73.11 
 
 
268 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  69.2 
 
 
267 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  70.66 
 
 
307 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  69.73 
 
 
269 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  71.09 
 
 
268 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  72.02 
 
 
272 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  66.67 
 
 
272 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  65.13 
 
 
285 aa  359  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  63.12 
 
 
266 aa  349  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  60.47 
 
 
279 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  62.45 
 
 
280 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  62.07 
 
 
265 aa  332  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  61.66 
 
 
286 aa  327  9e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.87 
 
 
286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  58.53 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  53.14 
 
 
280 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  59.06 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.06 
 
 
267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  63.07 
 
 
277 aa  311  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.35 
 
 
271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  59.35 
 
 
276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  57.65 
 
 
268 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  58.04 
 
 
270 aa  305  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  58.27 
 
 
284 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  58.68 
 
 
260 aa  301  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  57.25 
 
 
271 aa  300  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  59 
 
 
279 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  55.76 
 
 
273 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  56.3 
 
 
260 aa  299  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  53.03 
 
 
285 aa  299  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  56.35 
 
 
275 aa  297  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.06 
 
 
271 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  57.36 
 
 
283 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  56.37 
 
 
260 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  57.36 
 
 
283 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  57.36 
 
 
283 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  55.64 
 
 
265 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.96 
 
 
270 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  57.75 
 
 
282 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  57.75 
 
 
282 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  57.75 
 
 
282 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  54.89 
 
 
265 aa  294  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  54.89 
 
 
265 aa  294  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  57.65 
 
 
270 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  55.12 
 
 
270 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  55.91 
 
 
272 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  55.51 
 
 
270 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  55.91 
 
 
270 aa  292  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  59.83 
 
 
260 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  60.16 
 
 
270 aa  289  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  55.34 
 
 
270 aa  289  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  55.98 
 
 
269 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  59 
 
 
260 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.9 
 
 
266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  55.51 
 
 
273 aa  285  7e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  57.03 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  51.23 
 
 
266 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  49.19 
 
 
267 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  48.26 
 
 
267 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  48.26 
 
 
267 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  47.88 
 
 
267 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 
308 aa  99.8  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.16 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  24.24 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  24.24 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.32 
 
 
278 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  30.41 
 
 
346 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  27.59 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  32.97 
 
 
4917 aa  83.6  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  31.67 
 
 
4844 aa  82.4  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  27.86 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.18 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.98 
 
 
290 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  29.05 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  29.85 
 
 
4979 aa  77.8  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1495  gas vesicle protein GvpN  26.4 
 
 
304 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.71 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  28.12 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  26.29 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  28.24 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  25.97 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>