41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4120 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  32.14 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  31.36 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  28.84 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  29.73 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  29.73 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  29.02 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  29.7 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  26.23 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  27.17 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  25.74 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  20.83 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  23.41 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  25.77 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  24.12 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  25.38 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  25.38 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  23.27 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  27 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  24.4 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  21.67 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  24.91 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  24.76 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  22.75 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  26.62 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  27.72 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  23.53 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  21.07 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  26.51 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  25.86 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  25.24 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  24.43 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  22.99 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  24.03 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  26.14 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  18.75 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  22.48 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  21.49 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  22.31 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  24.09 
 
 		 267 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  24.55 
 
 		 266 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0794565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>