18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1999 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  87.16 
 
 		 278 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  78.21 
 
 		 273 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  68.38 
 
 		 274 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  42.37 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  37.9 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  37.9 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  40.73 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  31.95 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  31.86 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  26.42 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  25.66 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  26.62 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  32.08 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  28.8 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  23.71 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  25.87 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  22.62 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>