21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1568 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  23.62 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  24.22 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  26.21 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  28.08 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  24.78 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  25.88 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  27.89 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  25.49 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  25.74 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  23.81 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  22.37 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  18.75 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  20.87 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  21.05 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  26.24 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  22.42 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4133  hypothetical protein  24.17 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  22.27 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  21.27 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>