25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0666 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  99.24 
 
 		 264 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  90.91 
 
 		 264 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  54.41 
 
 		 266 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  38.06 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  36.44 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  35.97 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  35.74 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  30.15 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  32.37 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  29.55 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  29.91 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  27.57 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  26.37 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  28.29 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  28.29 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  28.29 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  26.32 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  25.49 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  21.54 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  25.2 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  26.12 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  26.96 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  38.03 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  25.77 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>