18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4045 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  76.45 
 
 		 278 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  78.12 
 
 		 278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  66.67 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  42 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  35.97 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  35.97 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  37.1 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  31.86 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  27.17 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  26.84 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  27.95 
 
 		 259 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  24.78 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  26.73 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  26.29 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  21.83 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  29.55 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>