23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0634 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  90.91 
 
 
264 aa  455  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  90.91 
 
 
264 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  57.09 
 
 
266 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  41.13 
 
 
278 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  39.27 
 
 
278 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  37.9 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  38.15 
 
 
274 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  29.02 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  31.4 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  30.54 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  27.54 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  28.63 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  25.63 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  28.78 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  28.78 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  28.78 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  25.98 
 
 
262 aa  52.8  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  25.48 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  29.93 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  27.59 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  26.09 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  36.62 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>