35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0538 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  27.2 
 
 		 252 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  26.02 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  25.48 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  25.22 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  28.92 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  25.66 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  25.74 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  22.75 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  23.98 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  23.81 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  24.7 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  23.35 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  24.88 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  23.39 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  21.82 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  23.08 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  20.5 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4133  hypothetical protein  26.5 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  26.64 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  26.32 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  26.32 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  21.64 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  20.71 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  23.4 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  18.69 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  21.39 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  22.81 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  18.65 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  21.59 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  21.59 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  24.88 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  26.52 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  23.22 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>