31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1773 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  89.51 
 
 
267 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  25.78 
 
 
263 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  25.28 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  25.28 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  25.28 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  29.3 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  30.16 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  23.53 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  26.83 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  26.18 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  26.95 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  24.24 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  23.83 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  28.11 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  24.49 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  20.26 
 
 
255 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  18.8 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  24.81 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  32.24 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  23.39 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  24.02 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  21.77 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  28.99 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  28.99 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  23.65 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  25.74 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  24.54 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  36.62 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  25.36 
 
 
261 aa  42  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>