29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2997 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  99.62 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  55.77 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  25.42 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  26.14 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  26.47 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  23.68 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  24.15 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  25.38 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  24.38 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  28 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  25.59 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  28.78 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  28.78 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  26.62 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  27.36 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  22 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  26.64 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  24.9 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  20.62 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  23.16 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  23.72 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  22.26 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  21.59 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  24.21 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  26.45 
 
 		 261 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  20.59 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  22.81 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>