28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0632 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  71.6 
 
 		 258 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  65.08 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  32.14 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  32.58 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  32.37 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  32.37 
 
 		 264 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  31.88 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  32.74 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  32.06 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  31.36 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  23.62 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  30.24 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  27.06 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  26.57 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  20.5 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  27.4 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  19.25 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  25.37 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  23.94 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  23.72 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  23.72 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  24.7 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  23.23 
 
 		 266 aa  45.4  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  24.15 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  26.32 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  28.09 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>