20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3303 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  69.92 
 
 		 278 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  70.93 
 
 		 278 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  67.05 
 
 		 273 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  47.64 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  38.65 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  38.65 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  37.35 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  32.58 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  33.18 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  29.1 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  26.21 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  30.77 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  22.75 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  28.09 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  30.77 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  24.89 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  24.22 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  23.61 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  23.66 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>