26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0192 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  43.8 
 
 
262 aa  198  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  28.84 
 
 
260 aa  92  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  28.92 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  25.4 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  24.51 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  27.27 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  27.06 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  26.07 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  21.08 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  26.84 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  22.43 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  25.47 
 
 
266 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  23.65 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  23.56 
 
 
260 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  41.89 
 
 
259 aa  55.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  26.82 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  26.15 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  20.51 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  26.64 
 
 
258 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  23.62 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  22.83 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4133  hypothetical protein  28.12 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  21.71 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  20.18 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  22.83 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>