24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5841 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5841  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0666  hypothetical protein  54.41 
 
 
264 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  0.0354499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0655  hypothetical protein  54.41 
 
 
264 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.214725  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0634  hypothetical protein  57.09 
 
 
264 aa  248  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.195766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  43.5 
 
 
278 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  42.8 
 
 
278 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4045  hypothetical protein  42 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3303  hypothetical protein  44.22 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  32.74 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  29.34 
 
 
258 aa  89  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1701  hypothetical protein  28.86 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  23.35 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0591  hypothetical protein  29.29 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  26.89 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  26.89 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  26.89 
 
 
265 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1568  hypothetical protein  27.89 
 
 
262 aa  59.3  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.471607  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  58.9  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  25.47 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  28.25 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  29.85 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  26.49 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  20.88 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  25.62 
 
 
249 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>