22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0992 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  75.1 
 
 		 260 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  61.54 
 
 		 260 aa  344  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  59.69 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  41.9 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  25.59 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  29.15 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  23.22 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  27.82 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  24.43 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  23.38 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  22.75 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  22.4 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  24.78 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  25.44 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  23.01 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  26.01 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  23.32 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  20.1 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  25.47 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  16.84 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  26.24 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>