24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1668 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  35.54 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  30.04 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  27.2 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  30.89 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  25.11 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  29.68 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  24.38 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  26.72 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  28.51 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  23.27 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  26.59 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  23.98 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4133  hypothetical protein  26.86 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  22.89 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  24.67 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  26.58 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  24.5 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  26.43 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  18.69 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  24.1 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  24.78 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  23.05 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  26.2 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>