32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3176 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  81.92 
 
 		 271 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  64.2 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  61.54 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  42.46 
 
 		 260 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  26.1 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  24.39 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  30.16 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  27.89 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  23.98 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  22.49 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  19.8 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  21.67 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  22.77 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  23.53 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  27.37 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  25.81 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  27.4 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  26.18 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  20.87 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  20.87 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  20.87 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  23.47 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  23.65 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  22.58 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  23.65 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  24.64 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  20.33 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  26.09 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  20.18 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  24.84 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  21.5 
 
 		 262 aa  42  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>