27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2130 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  45.28 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  42.46 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  44.36 
 
 		 271 aa  201  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  41.9 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  27.86 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  27.32 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  28.91 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  29.62 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  25.93 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  28.87 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  23.9 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  26.79 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  24.75 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  24.6 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  26.24 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  23.51 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  23.66 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  20.71 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  27.75 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  21.47 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3391  hypothetical protein  26.84 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  26.51 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  22.03 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  22.46 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  20.78 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1999  hypothetical protein  25.97 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.783842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>