29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1275 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  547  1e-155  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  36.4 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  31.2 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  28.11 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  31.65 
 
 		 224 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  24.39 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  25.99 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  25.76 
 
 		 275 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  25.76 
 
 		 275 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  25.48 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  25.49 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0714  hypothetical protein  23.69 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.570099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  25.12 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1837  hypothetical protein  25.42 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  27.16 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  22.8 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  21.2 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  24.04 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2130  hypothetical protein  27.32 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  24.19 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1773  hypothetical protein  22.62 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.938201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  27.5 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  24.51 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4120  hypothetical protein  20.83 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  23.36 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0992  hypothetical protein  23.7 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.489151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3349  hypothetical protein  20.18 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4133  hypothetical protein  19.59 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  21.03 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>