17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1357 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1357  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3211  putative integral membrane protein  26.43 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  0.0103033 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1275  hypothetical protein  21.2 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.298884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5922  hypothetical protein  25.74 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235163  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0221  hypothetical protein  21.95 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0032159  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9307  hypothetical protein  28.42 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1030  hypothetical protein  22.44 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.275581  normal  0.132673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1721  hypothetical protein  23.78 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00456561  normal  0.931616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0192  hypothetical protein  23.65 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.698451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1668  hypothetical protein  26.69 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1148  hypothetical protein  24.62 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0632  hypothetical protein  25 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4133  hypothetical protein  24.23 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2097  hypothetical protein  25.48 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206136 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0538  hypothetical protein  18.65 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5090  hypothetical protein  30.56 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3554  hypothetical protein  23.28 
 
 		 258 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>