296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1050 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  60 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  49.79 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  56.45 
 
 		 263 aa  205  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  56.45 
 
 		 272 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  52.78 
 
 		 238 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  54.03 
 
 		 201 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  52.53 
 
 		 255 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  53.37 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  53.03 
 
 		 201 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  47.3 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  57.38 
 
 		 251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  57.38 
 
 		 251 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  53.65 
 
 		 259 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  48.47 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  55.98 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  51.52 
 
 		 201 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  54.55 
 
 		 205 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  50.24 
 
 		 224 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  53.23 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  51.31 
 
 		 219 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  51.31 
 
 		 219 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  53.69 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  51.96 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  47.03 
 
 		 209 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  44.75 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  44.24 
 
 		 207 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  42.93 
 
 		 203 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  46 
 
 		 207 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  35.96 
 
 		 204 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  38.24 
 
 		 194 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  39.27 
 
 		 196 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  39.79 
 
 		 204 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  39.27 
 
 		 204 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  39.89 
 
 		 199 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  45.3 
 
 		 178 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  41.86 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  41.81 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  37.37 
 
 		 186 aa  99.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  95.9  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  39.39 
 
 		 181 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  34.07 
 
 		 154 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  37.44 
 
 		 186 aa  92.8  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  34.76 
 
 		 196 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  34.64 
 
 		 150 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  34.64 
 
 		 150 aa  89.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  34.64 
 
 		 150 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  35.77 
 
 		 169 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  38.33 
 
 		 151 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  38.58 
 
 		 151 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  39.17 
 
 		 151 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  39.47 
 
 		 153 aa  87.4  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  37.65 
 
 		 161 aa  86.3  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  30.67 
 
 		 153 aa  85.9  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  29.83 
 
 		 169 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  37.5 
 
 		 209 aa  85.9  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  31.37 
 
 		 152 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  29.83 
 
 		 169 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  31.37 
 
 		 152 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  39.82 
 
 		 140 aa  85.9  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  39.45 
 
 		 151 aa  85.9  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  38.94 
 
 		 150 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  38.94 
 
 		 150 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  38.94 
 
 		 150 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  40.83 
 
 		 152 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  38.94 
 
 		 150 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  38.94 
 
 		 150 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  38.94 
 
 		 150 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  38.94 
 
 		 140 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  32.24 
 
 		 152 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  37.5 
 
 		 151 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  33.99 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  38.94 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  38.53 
 
 		 152 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  38.94 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  38.53 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  34.81 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  30.67 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  38.71 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  37 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  38.05 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  34.91 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  35.5 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  38.05 
 
 		 150 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  38.05 
 
 		 140 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  38.05 
 
 		 150 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.4 
 
 		 153 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  38.05 
 
 		 150 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  38.05 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  38.05 
 
 		 154 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  38.05 
 
 		 154 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  37.17 
 
 		 150 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  40.32 
 
 		 159 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  38.74 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  37.96 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  32.24 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  36.7 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  35.4 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  34.18 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>