293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4070 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  93.53 
 
 
201 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  78.57 
 
 
204 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  78.77 
 
 
205 aa  298  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  62.21 
 
 
219 aa  230  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  62.21 
 
 
219 aa  230  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  55.12 
 
 
224 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  61.05 
 
 
220 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  56.5 
 
 
286 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  50.57 
 
 
209 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  53.63 
 
 
253 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  50 
 
 
201 aa  191  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  47.42 
 
 
272 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  50.85 
 
 
238 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  48.6 
 
 
263 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  53.18 
 
 
255 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  48.6 
 
 
262 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  53.76 
 
 
251 aa  185  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  54.34 
 
 
257 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  53.76 
 
 
251 aa  185  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  48.6 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  52.97 
 
 
314 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  47.46 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  51.74 
 
 
279 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  47.34 
 
 
260 aa  167  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  46.49 
 
 
206 aa  164  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  49.15 
 
 
204 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  46.29 
 
 
204 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  46.29 
 
 
204 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  44.92 
 
 
203 aa  157  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  46.51 
 
 
207 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  47.09 
 
 
196 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  43.75 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  48.12 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  43.26 
 
 
225 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  40.44 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  41.4 
 
 
178 aa  127  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  40.72 
 
 
186 aa  117  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  38.04 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  40.32 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  40.38 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  36.91 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  42.15 
 
 
153 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  35.9 
 
 
165 aa  93.2  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  38.28 
 
 
151 aa  90.1  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  36.89 
 
 
150 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  36.89 
 
 
150 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  36.89 
 
 
150 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  36.89 
 
 
154 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  36.89 
 
 
154 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  34.38 
 
 
151 aa  89  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  33.77 
 
 
150 aa  88.2  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  33.78 
 
 
154 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  30.52 
 
 
158 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  35.16 
 
 
151 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  36.89 
 
 
150 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  32.65 
 
 
154 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  36.89 
 
 
150 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  36.89 
 
 
150 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  34 
 
 
154 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  30.13 
 
 
152 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  36.07 
 
 
150 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  36.07 
 
 
150 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  36.07 
 
 
150 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  36.07 
 
 
150 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  36.07 
 
 
150 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  36.07 
 
 
150 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.54 
 
 
153 aa  85.5  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  30.67 
 
 
153 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  36.07 
 
 
154 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  35.06 
 
 
151 aa  85.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  36.07 
 
 
154 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  32.33 
 
 
151 aa  85.1  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  34.78 
 
 
154 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  84.7  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  29.61 
 
 
151 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  33.56 
 
 
154 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  31.82 
 
 
151 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  34.43 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  33.87 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  31.51 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  34.56 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  33.87 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  31.43 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  29.61 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  30.82 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  28.74 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  32.31 
 
 
153 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  35.14 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  33.99 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  37.04 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  40.19 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  30.83 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  30.83 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  35.14 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  33.77 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  35.14 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  31.61 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>