297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0164 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  76.85 
 
 		 201 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  78.28 
 
 		 201 aa  321  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  76.54 
 
 		 205 aa  285  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  53.02 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  57.07 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  57.07 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  58.96 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  50.83 
 
 		 209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  51.26 
 
 		 286 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  50.75 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  52.22 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  50.57 
 
 		 253 aa  184  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  48.3 
 
 		 262 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  50 
 
 		 255 aa  184  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  46.88 
 
 		 272 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  54.55 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  54.55 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  53.26 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  51.28 
 
 		 314 aa  181  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  45.55 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  45.74 
 
 		 259 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  45.74 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  53.53 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  46.77 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  49.7 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  47.49 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  48 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  47.43 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  47.43 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  47.25 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  46.89 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  44.44 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  49.38 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  46.74 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  40.78 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  39.56 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  43.71 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  38.04 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  42.58 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  38.8 
 
 		 181 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  37.75 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  40.41 
 
 		 176 aa  99.4  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  37.19 
 
 		 151 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  93.2  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  35.53 
 
 		 151 aa  92.8  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  36.21 
 
 		 165 aa  92.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  38.14 
 
 		 150 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  38.14 
 
 		 150 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  38.14 
 
 		 154 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  38.14 
 
 		 150 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  38.14 
 
 		 154 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  36.07 
 
 		 151 aa  91.3  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  38.98 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  38.98 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  33.77 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  34 
 
 		 154 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  38.98 
 
 		 150 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  34.93 
 
 		 154 aa  90.1  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  36.44 
 
 		 154 aa  89.4  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  89.4  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  34.9 
 
 		 161 aa  89.4  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  89.4  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  35.83 
 
 		 150 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  40.17 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  35.54 
 
 		 151 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  36.44 
 
 		 150 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  37.29 
 
 		 150 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  37.29 
 
 		 150 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  37.29 
 
 		 154 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  37.29 
 
 		 150 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  37.29 
 
 		 154 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  37.29 
 
 		 150 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  37.29 
 
 		 150 aa  88.2  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  37.29 
 
 		 150 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  35.81 
 
 		 151 aa  87.8  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  33.79 
 
 		 154 aa  87.8  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  34.21 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  34.01 
 
 		 152 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  34.76 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  34.71 
 
 		 151 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  35.59 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  33.56 
 
 		 154 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  37.25 
 
 		 159 aa  86.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  39.81 
 
 		 140 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.59 
 
 		 153 aa  86.3  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  40.78 
 
 		 140 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  32.45 
 
 		 153 aa  85.1  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  29.01 
 
 		 152 aa  84.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  33.08 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  31.29 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  32.45 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  33.99 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  32.48 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  35.48 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  41.58 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  32.28 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  37.61 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  34.42 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>