More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0021 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  85.61 
 
 		 263 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  71.1 
 
 		 262 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  69.35 
 
 		 259 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  70.31 
 
 		 253 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  72.03 
 
 		 259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  69.2 
 
 		 272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  57.89 
 
 		 201 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  56.32 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  61.8 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  53.69 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  55.95 
 
 		 205 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  57.54 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  55.37 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  57.47 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  53.33 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  51.45 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  51.45 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  54.55 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  54.55 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  51.45 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  47.34 
 
 		 201 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  47.31 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  50.85 
 
 		 209 aa  178  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  47.09 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  55.21 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  42.11 
 
 		 203 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  46.07 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  45.4 
 
 		 194 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  46.51 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  46.51 
 
 		 204 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  47.65 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  45.93 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  43.2 
 
 		 196 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  49.36 
 
 		 199 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  46.25 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  45.96 
 
 		 201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  44.31 
 
 		 178 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  44.67 
 
 		 176 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  44.17 
 
 		 181 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  41.62 
 
 		 186 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  39.87 
 
 		 186 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  40.83 
 
 		 151 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  37.69 
 
 		 152 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  39.37 
 
 		 152 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  40.85 
 
 		 150 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  40.85 
 
 		 153 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  39.37 
 
 		 152 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  40.43 
 
 		 171 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  41.01 
 
 		 171 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  36.42 
 
 		 153 aa  98.6  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  40.43 
 
 		 171 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  33.12 
 
 		 159 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  38.4 
 
 		 154 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  38.94 
 
 		 153 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  40.35 
 
 		 169 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  40.35 
 
 		 152 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  38.46 
 
 		 171 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  39.47 
 
 		 169 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  39.47 
 
 		 169 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  41.22 
 
 		 159 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  35.66 
 
 		 161 aa  93.6  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  40.8 
 
 		 152 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  92.8  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  39.06 
 
 		 159 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  39.13 
 
 		 152 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  37.4 
 
 		 151 aa  89.4  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  35.48 
 
 		 154 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  40.18 
 
 		 140 aa  89  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  35.48 
 
 		 154 aa  89  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  33.78 
 
 		 153 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  39.84 
 
 		 159 aa  88.6  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  36.02 
 
 		 209 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  34.87 
 
 		 154 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  37.5 
 
 		 151 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  33.55 
 
 		 153 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  33.87 
 
 		 153 aa  88.2  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  38.64 
 
 		 181 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  38.18 
 
 		 158 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  41.07 
 
 		 145 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  37.19 
 
 		 154 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  31.21 
 
 		 196 aa  87  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  86.3  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  36.89 
 
 		 150 aa  86.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  35.96 
 
 		 158 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  39.53 
 
 		 160 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  85.5  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  39.29 
 
 		 150 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  39.29 
 
 		 150 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  39.29 
 
 		 150 aa  85.5  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  36.94 
 
 		 173 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  39.29 
 
 		 150 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  39.29 
 
 		 150 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  39.29 
 
 		 150 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  38.39 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  39.67 
 
 		 142 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  38.39 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  39.29 
 
 		 154 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>