More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3625 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  51.41 
 
 		 257 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  52.36 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  52.3 
 
 		 255 aa  175  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  51.87 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  48.72 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  49.43 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  50.57 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  49.43 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  48.37 
 
 		 203 aa  168  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  51.76 
 
 		 286 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  49.7 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  47.7 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  47.75 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  47.75 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  47.09 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  49.41 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  46.51 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  46.86 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  47.34 
 
 		 263 aa  158  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  46.51 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  46.15 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  48.19 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  48.84 
 
 		 220 aa  151  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  48.37 
 
 		 259 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  44.97 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  52.26 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  46.15 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  47.65 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  43.48 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  46 
 
 		 314 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  45.9 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  44.9 
 
 		 209 aa  138  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  45.14 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  51.33 
 
 		 178 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  45.51 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  48.08 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  46.9 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  45.83 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  40.51 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  38.65 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  49.11 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  42.75 
 
 		 151 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  44.12 
 
 		 153 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  39.69 
 
 		 151 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  38.73 
 
 		 158 aa  101  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  101  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  38.17 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  39.01 
 
 		 161 aa  99  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  42.97 
 
 		 152 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  42.97 
 
 		 152 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  37.75 
 
 		 151 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  40 
 
 		 140 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  38.4 
 
 		 154 aa  96.7  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  37.58 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  37.6 
 
 		 154 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  38.89 
 
 		 154 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  37.09 
 
 		 153 aa  95.9  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  40.14 
 
 		 151 aa  95.9  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  38.35 
 
 		 153 aa  94.7  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  44 
 
 		 151 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  34.9 
 
 		 154 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  38.93 
 
 		 153 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  34.9 
 
 		 154 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  41.32 
 
 		 153 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  37.3 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  94  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  42.06 
 
 		 150 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  42.06 
 
 		 153 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  37.3 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  37.3 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  37.29 
 
 		 152 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  34.23 
 
 		 154 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  34.23 
 
 		 150 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  34.23 
 
 		 154 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  34.23 
 
 		 150 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  39.39 
 
 		 152 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  34.88 
 
 		 150 aa  92.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  34.23 
 
 		 150 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  40.68 
 
 		 151 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  35.38 
 
 		 165 aa  92  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  38.58 
 
 		 151 aa  92  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  37.29 
 
 		 152 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  38.03 
 
 		 161 aa  92  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  36.36 
 
 		 140 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  39.5 
 
 		 151 aa  91.7  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  36.51 
 
 		 150 aa  91.3  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  40.46 
 
 		 165 aa  91.3  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  37.69 
 
 		 151 aa  91.3  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  37.23 
 
 		 150 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  39.83 
 
 		 151 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  39.37 
 
 		 169 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>