More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7453 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7453  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3300  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  49.61 
 
 
262 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4434  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  51.95 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2935  extracellular solute-binding protein  48.84 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0120  extracellular solute-binding protein  48.84 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.54 
 
 
264 aa  242  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.1 
 
 
264 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.1 
 
 
264 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.1 
 
 
264 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.1 
 
 
264 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1368  extracellular solute-binding protein  47.13 
 
 
259 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.1 
 
 
264 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  53.1 
 
 
264 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  53.1 
 
 
264 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0119  extracellular solute-binding protein  48.45 
 
 
262 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876224  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.65 
 
 
265 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0821  extracellular solute-binding protein  51.28 
 
 
259 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206084  normal  0.0792038 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0741  extracellular solute-binding protein  51.71 
 
 
259 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0724  extracellular solute-binding protein  51.71 
 
 
259 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150259  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0366  extracellular solute-binding protein  51.06 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.996881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0849  extracellular solute-binding protein  51.06 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3432  extracellular solute-binding protein  48.78 
 
 
259 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0032  extracellular solute-binding protein family 3  51.3 
 
 
262 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0134  extracellular solute-binding protein  50.85 
 
 
264 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2538  extracellular solute-binding protein  51.08 
 
 
259 aa  238  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527572  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3939  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50.64 
 
 
259 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  hitchhiker  0.00393875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1566  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.21 
 
 
264 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0120  extracellular solute-binding protein  50.43 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614361  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  52.65 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  52.65 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0110  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  52.65 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2071  extracellular solute-binding protein family 3  47.81 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.012684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2917  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  51.77 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  52.65 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0016  extracellular solute-binding protein  46.12 
 
 
263 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  47.56 
 
 
255 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4297  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  52.21 
 
 
264 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1449  extracellular solute-binding protein family 3  47.37 
 
 
258 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2491  extracellular solute-binding protein family 3  46.9 
 
 
258 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1569  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  49.57 
 
 
264 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2972  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  49.57 
 
 
273 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0156  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  49.57 
 
 
264 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3338  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  49.57 
 
 
264 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4025  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  49.57 
 
 
264 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3952  amino acid-binding periplasmic transport protein  49.57 
 
 
264 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3033  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  49.57 
 
 
264 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2469  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50 
 
 
256 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1970  extracellular solute-binding protein  43.85 
 
 
257 aa  225  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3294  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  46.56 
 
 
264 aa  224  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5463  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.92 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1067  extracellular solute-binding protein  53.1 
 
 
264 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5997  extracellular solute-binding protein  46.7 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1067  extracellular solute-binding protein  52.65 
 
 
264 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2378  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic-binding protein  43.53 
 
 
257 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669572  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6551  extracellular solute-binding protein  46.7 
 
 
260 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.683047 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5703  extracellular solute-binding protein  46.7 
 
 
260 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6067  extracellular solute-binding protein  46.7 
 
 
260 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  45.61 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  43.44 
 
 
267 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  43.44 
 
 
267 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26240  periplasmic histidine-binding protein HisJ  50 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279452  normal  0.75514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.63 
 
 
260 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2163  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.2 
 
 
258 aa  214  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0442479  decreased coverage  0.0000000159985 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  41.63 
 
 
260 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.63 
 
 
260 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  44 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2131  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.54 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.61 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.6 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.61 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.74 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.49 
 
 
257 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  42.91 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.21 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2109  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.54 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0792  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.54 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1496  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.54 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1806  lysine-arginine-ornithine transport system, binding exported protein  42.54 
 
 
262 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.81 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0376  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  42.54 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  43.39 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0474  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  42.54 
 
 
260 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  44.3 
 
 
260 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.22 
 
 
260 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  48.23 
 
 
264 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.49 
 
 
363 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  48.23 
 
 
264 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.05 
 
 
260 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  48.23 
 
 
262 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1090  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  44.05 
 
 
258 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5004  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.6 
 
 
257 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2408  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.37 
 
 
260 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  0.0134444 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1792  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  45.37 
 
 
260 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2404  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.37 
 
 
260 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.634533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2043  extracellular solute-binding protein family 3  43.86 
 
 
260 aa  208  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000188394 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1248  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.05 
 
 
324 aa  208  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.37 
 
 
260 aa  208  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5731  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.93 
 
 
260 aa  208  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0988  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  44.05 
 
 
258 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.310906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>