More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1368 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1368  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0119  extracellular solute-binding protein  70.31 
 
 
262 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876224  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3300  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  70.04 
 
 
262 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3294  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  69.7 
 
 
264 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2935  extracellular solute-binding protein  70.43 
 
 
262 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0120  extracellular solute-binding protein  70.43 
 
 
262 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0134  extracellular solute-binding protein  72.36 
 
 
264 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0110  extracellular solute-binding protein  73.31 
 
 
281 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0120  extracellular solute-binding protein  73.31 
 
 
262 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.614361  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4025  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  74.15 
 
 
264 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3952  amino acid-binding periplasmic transport protein  74.15 
 
 
264 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0016  extracellular solute-binding protein  67.3 
 
 
263 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2972  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  73.73 
 
 
273 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3338  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  73.73 
 
 
264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0156  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  73.73 
 
 
264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3033  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  73.73 
 
 
264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1569  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  73.73 
 
 
264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4434  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  70.34 
 
 
264 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0032  extracellular solute-binding protein family 3  70.34 
 
 
262 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2491  extracellular solute-binding protein family 3  68.49 
 
 
258 aa  349  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38007  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1970  extracellular solute-binding protein  63.67 
 
 
257 aa  338  5.9999999999999996e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1449  extracellular solute-binding protein family 3  65.55 
 
 
258 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1566  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  63.25 
 
 
264 aa  308  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2917  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  62.82 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  63.25 
 
 
265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  62.39 
 
 
264 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  61.54 
 
 
264 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  61.54 
 
 
264 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.54 
 
 
264 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.54 
 
 
264 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.54 
 
 
264 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.54 
 
 
264 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  61.54 
 
 
264 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3432  extracellular solute-binding protein  58.57 
 
 
259 aa  295  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4297  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  61.97 
 
 
264 aa  295  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  61.54 
 
 
264 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  61.54 
 
 
264 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  61.54 
 
 
264 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  61.54 
 
 
264 aa  291  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2071  extracellular solute-binding protein family 3  58 
 
 
262 aa  291  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.012684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3939  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  60.17 
 
 
259 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  hitchhiker  0.00393875 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  56.57 
 
 
255 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0724  extracellular solute-binding protein  59.31 
 
 
259 aa  284  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0741  extracellular solute-binding protein  59.31 
 
 
259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0821  extracellular solute-binding protein  59.74 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206084  normal  0.0792038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0366  extracellular solute-binding protein  59.31 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.996881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0849  extracellular solute-binding protein  59.31 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2538  extracellular solute-binding protein  58.87 
 
 
259 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527572  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1067  extracellular solute-binding protein  60.26 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1067  extracellular solute-binding protein  60.26 
 
 
264 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  54.94 
 
 
260 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2131  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.67 
 
 
262 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  54.94 
 
 
260 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2449  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.81 
 
 
258 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.455692  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50.2 
 
 
267 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0890  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.82 
 
 
363 aa  262  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.65 
 
 
260 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5703  extracellular solute-binding protein  54.82 
 
 
260 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6067  extracellular solute-binding protein  54.82 
 
 
260 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2314  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  53.95 
 
 
258 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.626493 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0474  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  52.67 
 
 
260 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2109  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.67 
 
 
260 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0792  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.67 
 
 
260 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1496  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.67 
 
 
260 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1806  lysine-arginine-ornithine transport system, binding exported protein  52.67 
 
 
262 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6551  extracellular solute-binding protein  54.51 
 
 
260 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.683047 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0376  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  52.67 
 
 
260 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  50.2 
 
 
267 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5463  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  51.39 
 
 
257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1792  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  52.97 
 
 
260 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2404  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.97 
 
 
260 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.634533  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  51.85 
 
 
260 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2408  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.97 
 
 
260 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  0.0134444 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  51.85 
 
 
260 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5997  extracellular solute-binding protein  54.08 
 
 
262 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  53.02 
 
 
267 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  53.02 
 
 
267 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1248  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.51 
 
 
324 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2378  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic-binding protein  51.39 
 
 
257 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669572  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1090  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  53.51 
 
 
258 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.33 
 
 
260 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1095  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  53.51 
 
 
258 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7504  extracellular solute-binding protein  52.4 
 
 
256 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0747  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.51 
 
 
258 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2163  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  49.8 
 
 
258 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0442479  decreased coverage  0.0000000159985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.33 
 
 
260 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2043  extracellular solute-binding protein family 3  52.7 
 
 
260 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000188394 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1579  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  53.51 
 
 
258 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0988  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  53.51 
 
 
258 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.310906  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5731  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.54 
 
 
260 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3018  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  53.51 
 
 
324 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280802  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  53.02 
 
 
267 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  51.55 
 
 
260 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50 
 
 
260 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  51.95 
 
 
260 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0179055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  49.03 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  52.81 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0886  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  52.12 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  50.39 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  50.39 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>