230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2976 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1325  GntR family regulatory protein  100 
 
 		 379 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3101  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2976  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2284  GntR family transcriptional regulator  98.43 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  43.5 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  41.23 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  42.79 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  41.23 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1259  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.268862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1974  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1742  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0150  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0405244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1821  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1016  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  41.23 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  41.23 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  41.23 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 239 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1804  GntR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2515  GntR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0149634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  40 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4715  GntR domain protein  35.71 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  34.45 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  34.59 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  32.59 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  31.88 
 
 		 261 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  31.31 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  32.32 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  26.51 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  29.88 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  35.06 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  28.05 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  30.24 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  26.05 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  29.81 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  29.26 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  29.26 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  29.26 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  29.26 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  34.44 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  34.44 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  34.44 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  31.05 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860554  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  34.91 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0632  GntR domain-containing protein  32.84 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  26.19 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  31.43 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5993  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  36.36 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  32 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  31.52 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  32.12 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5910  GntR domain-containing protein  32.32 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0589896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  28.04 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0501  GntR domain-containing protein  32.5 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  32.68 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  30.46 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  31.93 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  31.71 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  30.23 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0940  GntR domain protein  28.32 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5327  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.941798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  26.04 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.88633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  28.89 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  27.88 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>