More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4715 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4715  GntR domain protein  100 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  42.61 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  41.67 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  41.67 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  42.54 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1259  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.268862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1974  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1016  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1821  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1742  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0150  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0405244  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  41.67 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  41.67 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  41.67 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  39.64 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2515  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0149634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1804  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2976  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 255 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3101  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 255 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161645  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1325  GntR family regulatory protein  35.71 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2284  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 439 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  31.43 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  27.15 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  28.05 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  32.78 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  32.78 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  32.78 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  31.86 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  33.95 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0632  GntR domain-containing protein  32.32 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  29.78 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  31.11 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  31.31 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  29.49 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3302  GntR domain protein  29.84 
 
 		 268 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.826091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5993  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 192 aa  85.1  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127437 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  29.27 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  27.27 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  30.33 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  25.33 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  25.62 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  30.53 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  27.27 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  26.75 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  26.11 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  29.91 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  29.79 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  28.18 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  34.03 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  27.44 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  26.76 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5910  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0589896  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.68 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  25.68 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  25.68 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  25.68 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  25.68 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1146  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  25.68 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  25.68 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  25.68 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  26.17 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  26.17 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  25.24 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  24.77 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  24.77 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  23.04 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  24.77 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0501  GntR domain-containing protein  30.59 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  31.61 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5327  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.941798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.88633 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5704  GntR domain protein  30.3 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  26.79 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  29.15 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>