41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1173 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1173  Oligoribonuclease  100 
 
 		 214 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.376915  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  25.82 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.95 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  26.67 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  26.13 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  27.13 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.87 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  27.27 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02760  oligoribonuclease, putative  25.68 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1713  DNA polymerase III subunit epsilon  35.29 
 
 		 293 aa  48.1  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.37 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  28.03 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  26.39 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  25.64 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  26.53 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  25.41 
 
 		 269 aa  46.2  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  25.4 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  25.17 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.39 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.51 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0586  oligoribonuclease  24.19 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.51167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  26.39 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  26.39 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  26.39 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  24.59 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3661  oligoribonuclease  24.59 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  24.59 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0387  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.04 
 
 		 180 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  25.54 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  28.28 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  25.64 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  25.17 
 
 		 214 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.37 
 
 		 235 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.7 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.5 
 
 		 183 aa  42  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.21 
 
 		 222 aa  42  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  26 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  24.74 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0985  oligoribonuclease  25.32 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  25.53 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.13 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>