121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0193 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0193  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  100 
 
 
114 aa  225  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0162  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  99.07 
 
 
163 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0213  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  94.78 
 
 
164 aa  209  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0169  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  97.22 
 
 
163 aa  207  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0191  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  97.22 
 
 
163 aa  207  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0156  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  96.3 
 
 
163 aa  206  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0171  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  96.3 
 
 
163 aa  206  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4352  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  36.08 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00101524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4446  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.05 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4747  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  36.08 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000130833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4736  RNA polymerase sigma-70 factor, ECF subfamily  36.08 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1215  RNA polymerase sigma factor  33.73 
 
 
161 aa  52  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1020  RNA polymerase sigma factor  33.8 
 
 
161 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1270  RNA polymerase sigma factor  33.8 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.125733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1169  RNA polymerase sigma factor  33.8 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00105347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4172  RNA polymerase sigma factor  34.29 
 
 
161 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1035  RNA polymerase sigma factor  36.07 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000122565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1012  RNA polymerase sigma factor  31.76 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1013  RNA polymerase sigma factor  36.07 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0372577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1113  RNA polymerase sigma factor  36.07 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1193  RNA polymerase sigma factor  31.76 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3082  RNA polymerase sigma factor SigM  31.88 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.258935  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3324  RNA polymerase sigma factor SigM  31.88 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2972  RNA polymerase sigma factor SigM  31.88 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000071254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3069  RNA polymerase sigma factor SigM  31.88 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3026  RNA polymerase sigma factor SigM  31.88 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0598  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.33 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3302  RNA polymerase sigma factor SigM  31.88 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3525  RNA polymerase sigma-70 factor  36.05 
 
 
295 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1214  sigma-24 (FecI-like)  35.71 
 
 
311 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4689  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  43.86 
 
 
252 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0439737  normal  0.0420679 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4155  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.39 
 
 
203 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00426853  hitchhiker  0.000149569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1408  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.6 
 
 
209 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1778  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  43.86 
 
 
248 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1379  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  43.86 
 
 
237 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1397  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  43.86 
 
 
237 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0562007  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1438  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.09 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1413  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  43.86 
 
 
237 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491366  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2429  RNA polymerase sigma factor SigM  30.88 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4190  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.6 
 
 
249 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6292  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.35 
 
 
219 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30730  RNA polymerase sigma-70 factor, TIGR02947 family  33.33 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.159272  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3675  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  27.16 
 
 
226 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000239341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1107  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.35 
 
 
226 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1266  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  42.86 
 
 
324 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19450  RNA polymerase, sigma subunit, ECF family  38 
 
 
239 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.880507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1861  RNA polymerase sigma factor SigW  32.79 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1658  RNA polymerase sigma factor SigW  32.79 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1636  RNA polymerase sigma factor SigW  32.79 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000576996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1605  RNA polymerase sigma factor SigW  32.79 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1789  RNA polymerase sigma factor SigW  32.79 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1655  RNA polymerase sigma factor SigW  32.79 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.124423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1912  RNA polymerase sigma factor SigW  32.79 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1838  RNA polymerase sigma factor SigW  32.79 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0277  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.207447  normal  0.83645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2156  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.65 
 
 
213 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144154  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0256  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  28.74 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00208601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4749  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.63 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0538  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  39.58 
 
 
212 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.104209  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13250  RNA polymerase sigma factor RpoE  40.35 
 
 
255 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.787212 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6315  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.93 
 
 
305 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3158  RNA polymerase sigma factor  35.09 
 
 
233 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148477  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1623  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.17 
 
 
327 aa  43.5  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0872  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  32.98 
 
 
186 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.028729  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1183  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.67 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4095  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.84 
 
 
268 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00330993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5189  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.21 
 
 
263 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0679696  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3540  RNA polymerase sigma factor SigW  31.15 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7737  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  38.6 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4938  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.51 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0964  RNA polymerase factor sigma C  24.24 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000360939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0756  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.67 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2250  sigma-24 (FecI-like)  29.17 
 
 
327 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1826  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.65 
 
 
235 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.184258  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1212  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.5 
 
 
257 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0501  RNA polymerase sigma factor SigZ  38.67 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0961  RNA polymerase sigma factor RpoE  33.33 
 
 
270 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2125  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.41 
 
 
205 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.726167  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0340  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  33.77 
 
 
202 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0706  RNA polymerase sigma factor  33.8 
 
 
232 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1071  RNA polymerase factor sigma C  29.27 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1110  RNA polymerase factor sigma C  24.24 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.8912e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1131  RNA polymerase factor sigma C  28.92 
 
 
177 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000936897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0953  RNA polymerase factor sigma C  24.24 
 
 
177 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.3630899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1741  sigma-24 (FecI-like)  43.14 
 
 
180 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0218052 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1032  RNA polymerase factor sigma C  24.24 
 
 
177 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000185519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2150  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.82 
 
 
198 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1006  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.03 
 
 
194 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10283  RNA polymerase ECF-type sigma factor  32.47 
 
 
181 aa  41.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1210  RNA polymerase sigma factor SigE  27.06 
 
 
230 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.380405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3708  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  36.84 
 
 
223 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.286878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4230  RNA polymerase factor sigma C  28.92 
 
 
177 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  hitchhiker  0.0000434661 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0942  RNA polymerase factor sigma C  24.24 
 
 
177 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000303197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1243  RNA polymerase sigma factor  32.88 
 
 
244 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.077005  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1067  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.64 
 
 
215 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267044  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3714  sigma-70 region 2 domain-containing protein  35.09 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4060  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.69 
 
 
323 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146183  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1083  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.38 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217835  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4954  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.92 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.35389  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18570  RNA polymerase, sigma subunit, ECF family  36 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0108313  normal  0.853054 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>