50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6819 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  287  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  61.81 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  65.44 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  59.44 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1449  phasin 2  59.03 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  64.89 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1014  phasin 2  57.64 
 
 		 148 aa  157  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3769  phasin  48.55 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0399298  normal  0.640636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0828  hypothetical protein  38.35 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0319  phasin  37.59 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.977242  normal  0.386124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0382  phasin  38.06 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0414  phasin  38.06 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34291  hitchhiker  0.0000940874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3941  phasin 2  35.9 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0172  phasin  35.88 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100821  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2345  phasin  37.27 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.861194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1250  phasin 2  32.48 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0474327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4617  phasin  30.77 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1448  phasin 2  31.62 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1470  phasin 2  31.62 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5203  phasin  31.78 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.410344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3768  hypothetical protein  31.2 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2947  phasin  31.93 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66474  normal  0.0420425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2499  phasin  32.43 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2223  phasin  32.43 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5600  phasin  33.61 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.606302  normal  0.602555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4277  phasin  35.29 
 
 		 210 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2181  phasin  35.09 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4356  phasin  35.2 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0095  hypothetical protein  35.19 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1013  hypothetical protein  32.69 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1257  hypothetical protein  31.48 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5741  phasin  29.81 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1910  phasin  30.77 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.152182  hitchhiker  0.0055421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5937  phasin  28.83 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0420528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2326  phasin  27.52 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2560  phasin  33.61 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.803417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2783  phasin  33.61 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2492  phasin  32.77 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0332487  normal  0.350636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0784  hypothetical protein  29.36 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4291  phasin  27.86 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336329  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5238  phasin  27.03 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6390  phasin  28.85 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3643  phasin 2  26.98 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0120  hypothetical protein  26 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2863  hypothetical protein  30.71 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00114886  normal  0.0679863 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8196  hypothetical protein  27.88 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  30.3 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5817  hypothetical protein  31.18 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41591  normal  0.243698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0683  hypothetical protein  23.3 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.551573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  25.71 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>