26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0351 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0351  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  224  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2258  hypothetical protein  82.14 
 
 		 112 aa  190  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2419  hypothetical protein  52.29 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00161449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4538  hypothetical protein  55.56 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3327  hypothetical protein  50.89 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1115  phasin family protein  48 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4776  hypothetical protein  49.07 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1669  hypothetical protein  45.45 
 
 		 113 aa  95.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.483467  normal  0.22423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1698  hypothetical protein  47.66 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00195798  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1570  phasin family protein  42 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0178691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1767  phasin family protein  43 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0749  hypothetical protein  45.95 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617519 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2539  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241276  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1923  hypothetical protein  37.37 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0862  phasin family protein  31.13 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0884748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1284  phasin family protein  34.04 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135426  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2407  hypothetical protein  35.71 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3145  phasin family protein  29.79 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3522  phasin family protein  36.99 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106265 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4616  phasin  30.77 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3940  phasin 2  30.23 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.705033  normal  0.931407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6819  hypothetical protein  30.3 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1251  phasin 2  27.27 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0500209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2839  phasin family protein  23.08 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0504  phasin  27.08 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1471  phasin 2 protein  27.91 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>